Згідно з фізико-географічним районуванням України, Молочний лиман відноситься до Присивасько-Приазовськоі' степової області Причорноморської південно-степової провінції. Поверхня даної території представляє собою рівнину зі слабким нахилом у південному напрямку. Вона підвищується над рівнем моря на 40 - 50 м у північній частині і на 5 - 10 м на узбережжі Азовського моря.